Realizacja projektu NCN Preludium 21 (2022/45/N/NZ9/01923)
Z przyjemnością informujemy o postępach
w realizacji projektu finansowanego przez Narodowe Centrum Nauki, Preludium 21 (2022/45/N/NZ9/01923) kierowanego przez dr Weronikę Babińską-Wensierską.
Badania prowadzone w ramach przedstawionego projektu obejmują szczegółową analizę mikrobiomu gleby uprawnej w kontekście jego wpływu na rozwój chorób takich jak czarna nóżka i mokra zgnilizna, wywoływanych przez bakterie pektynolityczne z rodzajów Dickeya i Pectobacterium.
Kierownik projektu Preludium 21 dr Weronika Babińska-Wensierska
Zebrane wyniki badań podczas pierwszego roku realizacji projektu były przedstawione w ramach prezentacji ustnych oraz plakatu na konferencjach krajowych jak i międzynarodowych:
- Babińska-Wensierska W., Smorawiński K., Motyka-Pomagruk A., Śledź W., Łojkwoska E. “Biodiversity of bacterial plant pathogens from the Pectobacteriaceae family on Polish waterways” 12th International Congress of Plant Pathology, Lyon, Francja, 20-25.08.2023, prezentacja plakatu
- Babińska-Wensierska W., Motyka-Pomagruk A., Fondi M., Mengoni A., Łojkowska E. “Does the microbiome of soil influence development of blackleg and soft rot diseases caused by Pectobacteriaceae?” Pectobacteriaceae satellite event, Lyon, Francja, 19-20.08.2023. Prezentacja ustna
- Babińska-Wensierska W., Motyka-Pomagruk A., Fondi A., Mengoni A., Łojkowska E. „Czy microbiom gleby uprawnej wpływa na rozwój chorób czarnej nóżki i mokrej zgnilizny wywoływanych przez bakterie pektynolityczne z rodzaju Dickeya i Pectobacterium?” VII National Microbiological Symposium „Metagenomy różnych środowisk”, Lublin, Polska, 20-21.06.2023. Prezentacja ustna
O dalszych postępach w realizacji projektu Preludium 21 będziemy informować na bieżąco:)
Realizacja projektu Preludium Bis-1 z NCN pod kierownictwem Prof. Ewy Łojkowskiej
Z przyjemnością informujemy o postępach w realizacji projektu NCN Preludium Bis-1 (2019/35/O/NZ1/02751) kierowanego przez Prof. Ewę Łojkowską.
W wykonywanie zadań badawczych jest zaangażowana również doktorantka, mgr Izabela Perkowska, która wygrała konkurs na stypendium zaplanowane w ramach przedmiotowego projektu oraz jej promotor pomocnicza dr Anna Ihnatowicz.
mgr Izabela Perkowska odbyła w trakcie realizacji projektu dwa staże naukowe:
- 09.2023 – 11.2023 (3 miesiące) Laboratoire Agronomie et Environnement, Université de Lorraine INRA – UMT1121, Vandœuvre-lès-Nancy, Francja Doświadczenie: Klonowanie molekularne, przejściowe ekspresja w roślinach, nadprodukcja i oczyszczanie białek, testy enzymatyczne, analiza metabolomiczna z wykorzystaniem HPLC-LTQ-Orbitrap-ESI-MS, oprogramowanie Compound Discoverer (finansowanie NAWA)
- 11.2021 (1 miesiąc) Laboratoire Agronomie et Environnement, Université de Lorraine INRA – UMT1121, Vandœuvre-lès-Nancy, Francja Doświadczenie: Klonowanie molekularne, nadprodukcja i oczyszczanie białek roślinnych, testy enzymatyczne, analiza HPLC/UPLC-MS
Projekt dotyczy poznania roli i mechanizmu regulacji ekspresji genów kodujących dioksygenazy w procesie adaptacji roślin do wzrostu i rozwoju w warunkach panujących na lądzie.
Warto podkreślić, że dioksygenazy to główne związki zaangażowane w degradację związków aromatycznych.
Zespół projektowy w trakcie realizacji projektu zebrał już bardzo interesujące dane o zależności pomiędzy akumulacją kumaryn, niedoborem żelaza a podatnością modelowej rośliny Arabidopsis thaliana na infekcję fitopatogennymi szczepami bakteryjnymi z rodzaju Dickeya.
Na szczególną uwagę zasługują:
→ zoptymalizowanie wzrostu Arabidopsis thaliana w kulturach hydroponicznych w warunkach stresu abiotycznego (jakim jest różny poziom jonów żelaza) oraz biotycznego (po inokulacji roślin zawiesiną bakterii z rodzaju Dickeya).
→ Opracowanie 6-stopniowej skali disease severity scale (DSS)
→ zoptymalizowanie metody badania poziomu ekspresji genów dioksygenaz w roślinach inokulowanych szczepami z rodzaju Dickeya,
Serdecznie zachęcamy do zapoznania się z tą pracą naukową:
→ Perkowska, I., Potrykus, M., Siwinska, J., Siudem, D., Lojkowska, E., & Ihnatowicz, A. (2021). Interplay between coumarin accumulation, iron deficiency and plant resistance to Dickeya spp. International Journal of Molecular Sciences, 22(12), 6449.
Ponadto efekty realizacji projektu przedstawiono dotąd w postaci 9 doniesień konferencyjnych:
• 10th Polish Society of Experimental Plant Biology Virtual Conference, Katowice 20.09.2021 –23.09.2021. Prezentacja ustna zatytułowana: “Effect of combined environmental stresses on plant health: study using the model system of Arabidopsis thaliana/Dickeya spp. molecular interactions”
Prezentacja wygłoszona przez Izabelę Perkowską; autorzy: Izabela Perkowska Marta
Potrykus, Joanna Siwińska, Dominika Siudem, Ewa Łojkowska, Anna Ihnatowicz
• 31st International Conference on Arabidopsis Research, ICAR2021 Virtual Conference 21.06.2021 – 25.06.2021. Prezentacja posteru: “Effect of iron deficiency on infection symptoms caused by Dickeya spp. in Arabidopsis thaliana” Izabela Perkowska, Marta Potrykus, Joanna Siwińska, Dominika Siudem, Ewa Łojkowska, Anna Ihnatowicz
• Iberian Plant Biology Congress, University of Minho, Braga, Portugal (09–12.07.2023). Prezentacja posteru zatytułowanego: “Interplay between dioxygenases involved in plant secondary metabolism and drought stress”. Prezentacja wygłoszona przez Izabelę Perkowską; autorzy: Izabela Perkowska, Alicja Januchowska, Alexandre Olry, Alain Hehn, Ewa Łojkowska, Anna Ihnatowicz
• 3rd PhD Meeting of Plant Science, University of Minho, Braga, Portugal (09.07.2023) Prezentacja ustna zatytułowana: “Role of dioxygenases in plant adaptation to oxidative and cold stress responses”. Prezentacja wygłoszona przez Izabelę Perkowską; autorzy: Izabela Perkowska, Alicja Januchowska, Alexandre Olry, Alain Hehn, Ewa Łojkowska, Anna Ihnatowicz
• International Scientific Conference On Plant Biodiversity & Sustainability (online) (13-14.10.2022). Prezentacja ustna zatytułowana: “The impact of Arabidopsis thaliana natural populations biodiversity on the content of simple coumarins”. Prezentacja wygłoszona przez Izabelę Perkowską; autorzy: Izabela Perkowska, Joanna Siwińska, Alexandre Orly, Jérémy Grosjean, Alain Hehn, Frédéric Bourgaud, Ewa Łojkowska, Anna Ihnatowicz
• 20th International Symposium on Iron Nutrition & Interactions in Plants ISINIP 2022, Reims, France (04.–08.07.2022). Prezentacja ustna (flash talk) zatytułowana: “Identification and characterization of Arabidopsis UDP-glucosyltransferase involved in scopolin biosynthesis”. Prezentacja wygłoszona przez Izabelę Perkowską; autorzy: Izabela Perkowska, Joanna Siwińska, Alexandre Orly, Jérémy Grosjean, Alain Hehn, Ewa Łojkowska, Anna Ihnatowicz
• 4th International Erwinia Workshop (IEW), Assisi, Italy (02. – 03.07.2022). Prezentacja posteru zatytułowanego: “Responses of Arabidopsis thaliana plants with disturbed coumarin accumulation to Dickeya dadantii and Dickeya solani infection” . Prezentacja wygłoszona przez prof. Ewę Łojkowską; autorzy: Izabela Perkowska, Marta Potrykus, Joanna Siwinska, Dominika Siudem, Ewa Łojkowska, Anna Ihnatowicz
• Plant Genomes in a Changing Environment 2021 Virtual Conference (18. – 20.10.2021). Prezentacja ustna (lightening talk) zatytułowana: “Variable profiles of simple coumarins between Arabidopsis thaliana accessions”Prezentacja wygłoszona przez Izabelę Perkowską; autorzy: Izabela Perkowska, Joanna Siwińska, Alexandre Orly, Jérémy Grosjean, Alain Hehn, Frédéric Bourgaud, Ewa Łojkowska, Anna Ihnatowicz
• European Federation of Biotechnology, EFB2021 Virtual Conference (10. – 14.10.2021). Prezentacja posteru (flash poster) zatytułowanego: “Profiling of coumarins in Arabidopsis thaliana accessions using UHPLC-MS”. Prezentacja wygłoszona przez Izabelę Perkowską; autorzy: Izabela Perkowska, Joanna Siwińska, Alexandre Orly, Jérémy Grosjean, Alain Hehn, Frédéric Bourgaud, Ewa Łojkowska, Anna Ihnatowicz
oraz w trakcie popularnonaukowego spotkania:
• „Młodzi dla Fahrenheita” – konferencja popularnonaukowa (Young for
Fahrenheit – popular science conference), Gdańsk, Poland 17 listopada 2021
Prezentacja ustna zatytułowana: “W służbie roślinom i ludziom. Identyfikacja genów
zaangażowanych w biosyntezę roślinnych związków farmakologicznie czynnych” Izabeli Perkowskiej
Obecnie zespół pracuje nad przygotowaniem trzech manuskryptów publikacji naukowych dotyczących:
- charakterystyki funkcjonalnej 2 genów kodujących dioksygenazy zależne od żelaza i oksoglutaranu w odpowiedzi roślin na stres osmotyczny (susza)
- analizy transkryptomu mutantów w genie kodującym jedną z badanych dioksygenaz w odpowiedzi na stres osmotyczny
- wpływu mutacji badanych genów na odpowiedź roślin na stres niskiej temperatury i stres oksydacyjny
