Realizacja projektu Preludium Bis-1 z NCN pod kierownictwem Prof. Ewy Łojkowskiej
Z przyjemnością informujemy o postępach w realizacji projektu NCN Preludium Bis-1 (2019/35/O/NZ1/02751) kierowanego przez Prof. Ewę Łojkowską.
W wykonywanie zadań badawczych jest zaangażowana również doktorantka, mgr Izabela Perkowska, która wygrała konkurs na stypendium zaplanowane w ramach przedmiotowego projektu.
Projekt dotyczy poznania roli i mechanizmu regulacji ekspresji genów kodujących dioksygenazy w procesie adaptacji roślin do wzrostu i rozwoju w warunkach panujących na lądzie.
Warto podkreślić, że dioksygenazy to główne związki zaangażowane w degradację związków aromatycznych.
Zespół projektowy w trakcie realizacji projektu zebrał już bardzo interesujące dane o zależności pomiędzy akumulacją kumaryn, niedoborem żelaza a podatnością modelowej rośliny Arabidopsis thaliana na infekcję fitopatogennymi szczepami bakteryjnymi z rodzaju Dickeya.
Na szczególną uwagę zasługują:
→ zoptymalizowanie wzrostu Arabidopsis thaliana w kulturach hydroponicznych w warunkach stresu abiotycznego (jakim jest różny poziom jonów żelaza) oraz biotycznego (po inokulacji roślin zawiesiną bakterii z rodzaju Dickeya).
→ Opracowanie 6-stopniowej skali disease severity scale (DSS)
→ zoptymalizowanie metody badania poziomu ekspresji genów dioksygenaz w roślinach inokulowanych szczepami z rodzaju Dickeya,
Serdecznie zachęcamy do zapoznania się z tą pracą naukową:
→ Perkowska, I., Potrykus, M., Siwinska, J., Siudem, D., Lojkowska, E., & Ihnatowicz, A. (2021). Interplay between coumarin accumulation, iron deficiency and plant resistance to Dickeya spp. International Journal of Molecular Sciences, 22(12), 6449.
Ponadto efekty realizacji projektu przedstawiono dotąd na dwóch konferencjach naukowych:
• 10th Polish Society of Experimental Plant Biology Virtual Conference, Katowice 20.09.2021 –23.09.2021. Prezentacja ustna zatytułowana: “Effect of combined environmental stresses on plant health: study using the model system of Arabidopsis thaliana/Dickeya spp. molecular interactions”
Prezentacja wygłoszona przez Izabelę Perkowską; autorzy: Izabela Perkowska Marta
Potrykus, Joanna Siwińska, Dominika Siudem, Ewa Łojkowska, Anna Ihnatowicz
• 31st International Conference on Arabidopsis Research, ICAR2021 Virtual Conference 21.06.2021 – 25.06.2021. Prezentacja posteru: “Effect of iron deficiency on infection symptoms caused by Dickeya spp. in Arabidopsis thaliana” Izabela Perkowska, Marta Potrykus, Joanna Siwińska, Dominika Siudem, Ewa Łojkowska, Anna Ihnatowicz
oraz w trakcie popularnonaukowego spotkania:
• „Młodzi dla Fahrenheita” – konferencja popularnonaukowa (Young for
Fahrenheit – popular science conference), Gdańsk, Poland 17 listopada 2021
Prezentacja ustna zatytułowana: “W służbie roślinom i ludziom. Identyfikacja genów
zaangażowanych w biosyntezę roślinnych związków farmakologicznie czynnych” Izabeli Perkowskiej
Realizacja projektu NCN Opus 17 kierowanego przez dr Wojciecha Śledzia
Chcieliśmy poinformować o progresie poczynionym w realizacji projektu OPUS 17 (2019/33/B/NZ9/00940), który został pozyskany z Narodowego Centrum Nauki.
Owocna współpraca z zespołem badawczym naszego konsorcjenta z Politechniki Wrocławskiej, dr hab. Anny Patrycji Dzimitrowicz, przyczyniła się do upowszechnienia dotychczasowych wyników badań w formie czterech publikacji naukowych:
Współpracownicy w ramach projektu OPUS 17 (od lewej): Prof. dr hab. inż. Paweł Pohl, dr hab. inż. Anna Dzimitrowicz (kierownik ze strony partnera), Prof. PWr dr hab. inż. Piotr Jamróz, dr Agata Motyka-Pomagruk, dr inż. Wojciech Śledź (kierownik projektu).
→ Dzimitrowicz, Anna, Piotr Jamroz, Pawel Pohl, Weronika Babinska, Dominik Terefinko, Wojciech Sledz, and Agata Motyka-Pomagruk. “Multivariate optimization of the FLC-dc-APGD-based reaction-discharge system for continuous production of a plasma-activated liquid of defined physicochemical and anti-phytopathogenic properties.” International Journal of Molecular Sciences 22, no. 9 (2021): 4813.
→ Motyka-Pomagruk, Agata, Anna Dzimitrowicz, Jakub Orlowski, Weronika Babinska, Dominik Terefinko, Michal Rychlowski, Michal Prusinski et al. “Implementation of a non-thermal atmospheric pressure plasma for eradication of plant pathogens from a surface of economically important seeds.” International Journal of Molecular Sciences 22, no. 17 (2021): 9256.
→ Babinska, Weronika, Agata Motyka-Pomagruk, Wojciech Sledz, Agnieszka Kowalczyk, Zbigniew Kaczynski, and Ewa Lojkowska. “The first Polish isolate of a novel species Pectobacterium aquaticum originates from a Pomeranian Lake.” International Journal of Environmental Research and Public Health 18, no. 9 (2021): 5041.
→ Dzimitrowicz, Anna, Pawel Pohl, Magda Caban, Piotr Jamroz, Piotr Cyganowski, Mateusz Bykowski, Aleksandra Klimczak, and Aleksandra Bielawska-Pohl. “How does direct current atmospheric pressure glow discharge application influence on physicochemical, nutritional, microbiological, and cytotoxic properties of orange juice?.” Food Chemistry 377 (2022): 131903.
Oraz dwóch patentów i jednego zgłoszenia patentowego:
→ ,,Sposób eradykacji bakteryjnych fitopatogenów oraz przepływowy układ reakcyjno-wykładowczy do realizacji tego sposobu”. Numer prawa wyłącznego Pat. 236055 z dnia 2020-07-24. Twórcy: Łojkowska Ewa, Śledź Wojciech, Motyka Agata, Anna Dzimitrowicz, Piotr Jamróz, Paweł Pohl. Zgłaszający: Politechnika Wrocławska i Uniwersytet Gdański.
→ ,,Sposób otrzymania preparatu do stymulacji wzrostu roślin, preparat otrzymany tym sposobem oraz zastosowanie preparatu do stymulacji wzrostu roślin, w szczególności tych istotnych gospodarczo”. Numer prawa wyłącznego Pat.236377 z dnia 2020-03-17. Twórcy: Agata Motyka-Pomagruk, Anna Dzimitrowicz, Weronika Babińska, Wojciech Śledź, Paweł Pohl, Piotr Jamróz, Dominik Terefinko, Ewa Łojkowska. Zgłaszający: Politechnika Wrocławska i Uniwersytet Gdański.
→ ,,Sposób ochrony roślin istotnych gospodarczo, zwłaszcza roślin naczyniowych, przed patogenami bakteryjnymi” Zgłoszenie patentowe (UP RP) nr P.438360 z dnia 2021-07-06. Twórcy: Dzimitrowicz Anna, Jamróz Piotr, Pohl Paweł, Terefinko Dominik, Motyka-Pomagruk Agata, Babińska Weronika, Śledź Wojciech, Łojkowska Ewa, Orłowski Jakub, Prusiński Michał. Zgłaszający: Politechnika Wrocławska i Uniwersytet Gdański.
Będziemy informować o kolejnych sukcesach:)
W dobie pandemii zachęcamy do skorzystania z oferty analiz przeciwwirusowych i antybakteryjnych właściwości produktów komercyjnych
W kwestii analiz wirusologicznych ostatnio poszerzyliśmy naszą ofertę o badania w zakresie wirusobójczości.
Analiza polega na określeniu skuteczności inaktywacji cząstek wirusowych przez różnego rodzaju środki chemiczne i fizyczne.
Dostępne podejścia:
→ Badanie wirusobójczości środków dezynfekujących i antyseptycznych.
→ Badanie wirusobójczości produktów tekstylnych, powierzchni nieporowatych, filtrów i aerozoli.
→ Badanie cytotoksyczności substancji płynnych i stałych (testy: Resazurin Cell Viability or MTT Cell Viability Assays)
Badania wirusobójczości które wykonujemy oparte są na następujących normach:
ISO 18184:2019 Textiles Determination of antiviral activity of textile
ISO 21702:2019 Measurement of antiviral activity on plastics and other non-porous surfaces products.
PN-EN 14476+A2:2019-08 (EN 14476:2013+A2:2019) Chemiczne środki dezynfekcyjne i antyseptyczne. Ilościowa zawiesinowa metoda określania wirusobójczego działania w obszarze medycznym.
PN-EN 16777:2019-01 (EN 16777:2018) Chemiczne środki dezynfekcyjne i antyseptyczne. Ilościowa powierzchniowa metoda określania wirusobójczego działania chemicznych środków dezynfekcyjnych stosowanych w obszarze medycznym na nieporowatych powierzchniach, bez działania mechanicznego.
PN-EN 17111:2018-12 (EN 17111:2018) Chemiczne środki dezynfekcyjne i antyseptyczne. Ilościowa nośnikowa metoda określania działania wirusobójczego do narzędzi stosowanych w obszarze medycznym.
PN-EN 14675 :2015 Chemiczne środki dezynfekcyjne i antyseptyczne – Ilościowa zawiesinowa metoda określania wirusobójczego działania chemicznych środków dezynfekcyjnych i antyseptycznych stosowanych w obszarze weterynarii.
W zależności od potrzeb możemy zastosować modelowe szczepy wirusowe takie jak:
Poliovirus type 1, Murine norovirus, Adenovirus type 5, Vaccinia virus, Bovine herpesvirus Type 1, Bovine enterovirus Type 1, Influenza A virus (H3N2), Feline calicivirus
Specjalne wydanie Acta Biochimica Polonica pod redakcją Prof. Ewy Łojkowskiej
W 100-tną rocznicę urodzin wielkiego uczonego Prof. Wacława Szybalskiego ukazał się numer specjalny Acta Biochimica Polonica dedykowany jego pamięci. Gościnnym edytorem tego wydania była profesor dr hab. Ewa Łojkowska, kierownik naszego laboratorium.
Patronat honorowy nad wspomnianym numerem 3/2021 Acta Biochimica Polonica pełni Komitet Biotechnologii PAN oraz Fundacja Profesora Wacława Szybalskiego.
Zachęcamy do zapoznania się z tą publikacją
Profesor Wacław Szybalski (1921 – 2020)
Urodzony we Lwowie, zmarły w Madison znakomity polski uczony, który pracę naukową prowadził przez ponad 45 lat w Uniwersytecie Stanu Wisconsin w Madison w USA. Był światowej sławy specjalistą z zakresu genetyki molekularnej oraz medycyny molekularnej. W naszej pamięci pozostanie jako wybitny naukowiec oraz mentor, wychowawca i wzór dla wielu polskich badaczy. Z Jego inicjatywy powołano w roku 2007 Fundację Profesora Wacława Szybalskiego, której celem jest działanie na rzecz wzmocnienia międzynarodowego prestiżu nauki polskiej oraz miasta Lwowa. Profesor otrzymał pięć doktoratów honoris causa. Aktywnie uczestniczył w realizacji światowego projektu poznania ludzkiego genomu. Dorobek naukowy obejmuje ponad 360 publikacji z zakresu mikrobiologii, genetyki ogólnej, mutagenezy oraz biologii molekularnej. Wiele lat pracował nad mechanizmami chemicznej mutagenezy i jako pierwszy dostarczył bezpośrednich dowodów na przyczynowy związek między mutagenezą a karcenogenezą. Również jego laboratorium stworzyło podstawy mapowania transkrypcji w bakteriofagu lambda. Ostatnie lata pracy profesora to poszukiwanie metod do fizycznego mapowania genomu, modyfikacji enzymów restrykcyjnych, a szczególnie sekwencjonowania dużych genomów.
Był członkiem zagranicznym Polskiej Akademii Nauk i Polskiej Akademii Umiejętności, honorowym członkiem Włoskiego Towarzystwa Biologii Doświadczalnej i Polskiego Towarzystwa Mikrobiologicznego. Był laureatem Medalu Hilldale Uniwersytetu Wisconsin, Złotego Medalu Grzegorza Mendla, przyznawanego przez Akademię Nauk Republiki Czeskiej oraz The 2003 Casimir Funk Natural Science Award, Polskiego Instytutu Sztuk i Nauk, Nowy Jork, 2003. Postanowieniem prezydenta Bronisława Komorowskiego z 22 kwietnia 2011 w uznaniu wybitnych osiągnięć w pracy naukowo-badawczej w dziedzinie biotechnologii i genetyki, za działalność dydaktyczną został odznaczony Krzyżem Wielkim Orderem Odrodzenia Polski, udekorowany został 3 maja tego samego roku w czasie uroczystości na Zamku Królewskim z okazji Święta Narodowego 3 Maja.
Wraz z prof. Karolem Taylorem i prof. Anną Podhajską był inicjatorem powstania Międzyuczelnianego Wydziału Biotechnologii Uniwersytetu Gdańskiego i Gdańskiego Uniwersytetu Medycznego.
Przedłużenie akredytacji w naszym laboratorium
Z przyjemnością informujemy, że Polskie Centrum Akredytacji przedłużyło akredytację naszego laboratorium na podstawie wyników przeprowadzonego dnia 30 lipca 2021 audytu technicznego i systemowego.
Dzięki pracom wykonywanym zgodnie z normą PN-EN ISO/IEC 17025:2018-02 możemy gwarantować Państwu najwyższą jakość świadczonych usług:)
Zapraszamy do submisji prac do wydania specjalnego Agronomy (ISSN 2073-4395) pod redakcją dr A. Motyki-Pomagruk
Zachęcamy do submisji publikacji do specjalnego wydania czasopisma Agronomy (ISBN: 2073-4395, 100 pkt MNiSW, IF = 2,603) pod tytułem ,,Comparative Genomic and Phenotypic Analyses of Significant Plant Pathogens” w sekcji “Pest and Disease Management” pod redakcją dr Agaty Motyki-Pomagruk, dr Moniki Kałużnej oraz dr Agnieszki Misztak.
Submisja prac jest możliwa do 30 kwietnia 2022.
Zapraszamy serdecznie do nadsyłania prac:)
dr Agata Motyka-Pomagruk uzyskała wyróżnienie w konkursie o Nagrodę Oddziału PAN w Gdańsku dla młodych naukowców
Prezydium Oddziału PAN w Gdańsku ogłosiło w tym roku VI edycję Nagrody Naukowej dla młodych naukowców. Przyznana została pięciu laureatom za oryginalne osiągnięcia badawcze w zakresie nauk: humanistycznych i społecznych, biologicznych i rolniczych, ścisłych i nauk o Ziemi, technicznych oraz medycznych pracownikom lub doktorantom instytucji naukowych w województwach: kujawsko-pomorskim, pomorskim i zachodniopomorskim.
Wyróżnienie w konkursie o Nagrodę Oddziału PAN w Gdańsku za najlepszą pracę twórczą opublikowaną w 2020 r. otrzymała dr Agata Motyka – Pomagruk z naszego laboratorium za publikację:
– Motyka-Pomagruk Agata, Żołędowska Sabina, Misztak Agnieszka E., Śledź Wojciech, Mengoni Alessio, Łojkowska Ewa. Comparative genomics and pangenome-oriented studies reveal high homogeneity of the agronomically relevant enterobacterial plant pathogen Dickeya solani. BMC Genomics 2020, 21: 449 (doi: 10.1186/s12864-020-06863-w)
Prof. dr hab. Ewa Łojkowska w DGP o komercjalizacji wyników badań naukowych
Zachęcamy do zapoznania się z najnowszym artykułem, opublikowanym w Dzienniku Gazecie Prawnej, w którym Prof. dr hab. Ewa Łojkowska opowiada o możliwościach komercjalizacji wyników badań naukowych i przybliża związane z tym przedsięwzięciem wyzwania.
Wspomina również o działalności badawczo-wdrożeniowej naszego Laboratorium:)
Prof. dr hab. Ewa Łojkowska powołana do Komitetu Ekspertów Programu RE-IMAGINE EUROPA
Z przyjemnością informujemy, że Prof. dr hab. Ewa Łojkowska została powołana do Komitetu Ekspertów Grupy Zadaniowej tworzonej przez Program RE-IMAGINE EUROPE, All European Academies (ALLEA) oraz European Sustainable Agriculture through Genome Editing (EU-SAGE) poświęconej „Zrównoważonemu rolnictwu i innowacjom” (ang. Task Force – Sustainable Agriculture and Innovation), której Przewodniczącym jest Carlos Moedas, Komisarz ds. Badań, Nauki i Innowacji w Komisji Europejskiej poprzedniej kadencji.
Celem Grupy Zadaniowej jest lepsze zrozumienie w jaki sposób strategia „Od pola do stołu” (ang. Field to Fork, F4F) może stać się kluczowym elementem Europejskiego Zielonego Ładu (ang. European Green Deal) i jak innowacje w rolnictwie, takie jak na przykład wykorzystanie edycji genomów roślin uprawnych metodą CRISPR, mogą pomóc w realizacji tej strategii. Celem Komitetu Ekspertów będzie określenie w jaki sposób, przy ambitnych celach klimatycznych, które są priorytetem Europy, możliwe jest opracowanie globalnego standardu zrównoważonego rozwoju rolnictwa przy jednoczesnej ochronie bioróżnorodności i ograniczeniach w użytkowaniu gruntów rolnych.